Начисление НДС, если фактически не произошло реализации покупателю

Здравствуйте, уважаемые форумчане!
У меня возник вопрос, для кого-то он может показаться глупым.
Заключили договор с очень известной компанией на несколько миллионов рублей. Согласно договора мы поставляем покупателю ТМЦ (в него входят материалы, что-то сами собрали) и на его территории с этого всего собираем оборудование и закрываем всё КС-2 и КС-3 (в 4-м квартале).
В 3-м квартале отгрузили комплектующие траспортникам и я выписала ТТН (1-Т).
При этом проводки я сделала ДТ 45 - КТ (43, 41, 10)
Пришла очередь начислять НДС. Подумав, я выписала счёт-фактуру на отгрузку, включила её в книгу продаж и заплатила НДС.
Проводки: ДТ 76(ОТ) - КТ 68.2
Мотивировала п. 1 ст. 167 НК, где сказано: "В целях настоящей главы моментом определения налоговой базы, является наиболее ранняя из следующих дат:
1) день отгрузки (передачи) товаров (работ, услуг), имущественных прав;
2) день оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг), передачи имущественных прав."
Товар мы передали транспортникам в 3 квартале, о чём есть акты выполненных работ.

Теперь очередь налога на прибыль. И вот здесь происходит несоответствие баз начисления по НДС и налогу на прибыль, так как реализации фактически покупателю не произошло (т.е., не было проводки ДТ 62.1 - КТ 90.1).
Думаю при подаче декларации по налогу на прибыль написать в налоговую писульку с изложением своей позиции.
Вот и хочу спросить - а я правильно всё сделала?